主要区别是，科目分类不同、外形特征不同、生活习性不同，具体如下：
一、科目分类不同1、小浣熊别称食物小偷、干脆面君。属哺乳纲、食肉目、浣熊科、浣熊属、浣熊种动物。
2、小熊猫别称红熊猫、红猫熊、九节狼、金狗。属哺乳纲、食肉目、小熊猫科、小熊猫属、小熊猫种动物。
小熊猫
二、外形特征不同1、小浣熊浣熊最大的特征是眼睛周围的黑色区域，与周围的白色的脸颜色形成鲜明对比。耳朵略圆，上方为白色毛，通常颜色深浅的灰色，也有部分为棕色和黑色、淡黄色，及罕见的白化种。浣熊尾长，有黑白环纹，也有少数为黄白相间，大约5-7个。树栖的蓬尾浣熊属和地栖的长鼻浣熊都有尾环，而卷尾浣熊的长尾（超过体长1.5-2.0倍）无环纹，前者的长尾有缠绕性。
2、小熊猫外形像猫，但较猫肥大，全身红褐色。圆脸，吻部较短，脸颊有白色斑纹。耳大，直立向前。四肢粗短，为黑褐色。尾长、较粗而蓬松，并有12条红暗相间的环纹；尾尖深褐色。头骨高而圆；听泡相对扁平，眶后突不完全发育或缺失，矢状嵴低；具翼碟骨，上腭高耸拱形，中间凹陷；中翼骨腭缢缩，冠突明显呈钩状。
小浣熊
三、生活习性不同1、小浣熊喜欢栖息在靠近河流、湖泊或池塘的树林中，它们大多成对或结成家族一起活动。浣熊白天大多在树上休息，晚上出来活动，经常在树上活动，巢也筑在树上。白天它们在空心树和岩石或地面上的洞中睡觉，当受到黑熊追踪时，它就会逃到树梢躲起来。虽然是食肉目动物，但浣熊偏于杂食，嗜捕食鸟、老鼠、昆虫、小鱼、蜗牛、小龙虾和青蛙。它们的食物也包括蛋类、坚果、谷物、水果和橡树籽等，不伤害人畜。
2、小熊猫平日栖居于大的树洞或石洞和岩石缝中。早晚出来活动觅食，白天多在洞里或大树的荫深处睡觉。睡时好把头蜷缩在四肢中，前肢抱住头部，以尾覆盖在身上。有时两脚下垂高卧于树枝上。善于攀爬，往往能爬到高而细的树枝上休息或躲避敌害。喜食箭竹的竹笋、嫩枝和竹叶，各种野果、树叶、苔藓、以及捕食小鸟或鸟卵和其它小动物、昆虫等，尤其喜食带有甜味的食物。
总的来说，小熊猫是小熊猫科小熊猫属的动物，体重较重，头部短宽，鼻上部、两颊、眼眉上都有白斑，尾部粗长。浣熊是浣熊科浣熊属的动物，头部眼睛周围有一圈深色皮毛，耳朵略圆，上方为白色毛，尾部有黑白环纹。
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